Fondé sur les dons généreux du public, le musée a également besoin d'un mécanisme pour s'autofinancer. La boutique du musée du 11 septembre permet de développer et d'entretenir le musée et le mémorial en proposant divers souvenirs permettant aux visiteurs de ramener chez eux l'inspiration qu'ils ont tirée de leur visite.
Des casquettes aux t-shirts en passant par les tasses et bien d'autres choses encore, le magasin a de quoi satisfaire tout le monde. Les marchandises sont vendues sous la marque populaire "N'oubliez jamais", qui laisse une forte empreinte dans les esprits et les cœurs. Les recettes du magasin ont également permis de soutenir de nombreuses associations caritatives.
